כן, ספינות מכולות יחוו לחץ מסוים במהלך ההובלה. הסיבה לכך היא שמיכלים עשויים להיות נתונים לכוחות חיצוניים שונים במהלך ההובלה, כגון רטט, בליטות ודחיסה. כוחות אלו גורמים למטען בתוך המכולה להפעיל לחץ על האנייה.
כדי להתמודד עם הלחץ הזה, ספינות מיכל עשויות בדרך כלל מחומרים- בעלי חוזק גבוה כדי להבטיח שהם יכולים לעמוד בלחצים השונים במהלך ההובלה. יתר על כן, עיצוב נכון הוא גם המפתח להפחתת הלחץ על האנייה; לדוגמה, דגמים מסוימים משתמשים בעיצוב דלת משולשת הפוכה כדי לתמוך ולפזר לחץ טוב יותר.
עם זאת, למרות זאת, יש צורך להימנע מעיכה מוגזמת או פגיעה במיכל במהלך ההובלה כדי למנוע נזק לאוניה. בדיקה ותחזוקה שוטפת של מצב האונייה גם היא חיונית כדי להבטיח את ביצועיה הטובים לאורך כל ההובלה.
לכן, למרות שספינות מכולות חוות לחץ מסוים במהלך ההובלה, ניתן להפחית ביעילות את ההשפעה של לחץ זה על המטען והאניה באמצעות בחירת חומרים, עיצוב וניהול הובלה נכונים.